但是，如果母乳喂养的母亲有以下疾病，甚至与婴儿接触时，应避免母乳喂养，以免影响婴儿和母亲的健康。
1. 如果母乳喂养的母亲患有
(尤其是活动性肺结核）、传染性肝炎（如甲肝、乙肝、丙肝）等传染病，必须与乳房分开，实行人工喂养，以免将疾病传给乳房。
2. 患有肾炎的哺乳期母亲可暂停哺乳，因为食物中的蛋白质受到限制，哺乳期要多食用蛋白质。
3. 患有癫痫的母亲不要给婴儿喂奶，因为癫痫发作会在喂奶时伤及婴儿，而且所服用的药物，如苯妥英，容易进入乳汁，引起虚脱、嗜睡、全身瘀斑等不良反应。
4. 患有糖尿病的哺乳期母亲在饮食和胰岛素治疗期间不宜喂奶。否则容易诱发糖尿病酮症昏迷，影响婴儿，只有在病情稳定、停药后才可哺乳。哪些情况下不宜母乳喂养
5. 患有甲状腺功能亢进或低下的母亲在用药期间不宜哺乳，以免引起乳房的甲状腺病变。
6. 患有急性传染病的母亲往往需要使用大量的抗生素药物，应暂停母乳喂养几天，防止药物通过乳汁危害婴儿。
7. 当孩子患有苯丙酮尿症时，应立即停止用母乳或其他牛奶喂养孩子，以免损害孩子的智力。