例如，导致体重下降的慢性疾病可能影响排卵。甲状腺疾病，如甲亢或慢性淋巴细胞性甲状腺炎，可能会中止排卵。慢性肝病和肾病也可能损害生育能力，因为它们干扰脑垂体的功能，而脑垂体产生一些月经周期正常运作所需的激素。如果你进行了肾脏移植，建议你在移植后至少等待18至24个月，直到你的血液蛋白水平下降并稳定下来，再尝试怀孕。
患有休斯综合征（抗磷脂综合征或简称APS）的妇女很可能因为血液凝固问题而流产，尽管使用低剂量阿司匹林和肝素的常规治疗可以大大降低这种风险。
用于治疗慢性疾病的药物也可能导致你或你丈夫出现生殖问题。例如，一些抗组胺药可能会影响精子的数量，而过去用于治疗风湿病的药物可能会影响女性的受孕能力。如果你或你的丈夫正在服用任何药物，在准备怀孕之前咨询你的医生是很重要的。
利用这个机会，询问你正在服用的药物在怀孕期间是否安全。这包括精神病治疗，如治疗精神分裂症和抑郁症的药物。类固醇有时被用来治疗
和狼疮，如果你怀孕或准备怀孕，通常可以安全服用。但是如果你有高血压，你可能要从常规药物如ACE抑制剂（血管紧张素转换酶抑制剂）换成对你发育中的婴儿更安全的药物。一些用于治疗癫痫的药物也可能导致出生缺陷，所以在你开始准备怀孕之前，要咨询医生是否需要换用其他药物。
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